日归档:2016 年 07 月 31 日

读书笔记(十)动物园

  本文地址:http://sokoban.ws/blog/?p=2833 最近连续读了三本和生命科学相关的书。又因为儿子的缘故,两个月内连续去了两个海洋极地馆或动物园。本文写写这些读书和见闻的收获。 一、动物 按照目前的生物分类理论,动物界(kingdom Animalia)是生物的六个界之一(其他五个为植物、真菌、原生生物、古菌、细菌)。最早的动物大概出现在7亿到6.7亿年前,只占地球生命史的一小部分,比地质年代中的显生宙略长。 动物目前约分为30个门(phylum)。这些门中,有一大部分是两侧对称的(bilateral symmetry)。对称性在粒子物理的规范场论中有非常重要的地位,动物也进化出某种对称性,这之间有没有什么内在联系呢?至于非两侧对称的动物,有多孔动物门和辐射对称的刺胞动物门(Cnidaria,如珊瑚虫、水母等)等。 大部分两侧对称动物有一条消化道,由此又分为前口动物和后口动物两大类。前口动物包括节肢动物门(如昆虫)、软体动物门、环节动物门等。后口动物含脊索动物门(Chordate)和棘皮动物门等。所以脊索动物门之外,与人类最接近的一个大门是棘皮动物,如海星。 再往下细分,脊索动物门的主体脊椎动物分为鱼类、两栖类、爬行类、鸟类和哺乳类五大类。哺乳动物中的灵长目除了含有大量不同种类的猴子外,还有四个属的大猿:红毛猩猩、大猩猩、黑猩猩和人。其中又以黑猩猩和人最亲。 现代人一个单一物种内部,也可以通过Y染色体DNA或mtDNA等推测史前人类族群的演化和迁徙。 从动物到人的进化路线,大体如此。 二、生命之树(Tree of Life) 沿着生命之树,从动物在往上追踪到生命的根节点,生命又该如何分类?对生物的分类,实际上也是对地球生命的起源和本质的探求。目前人类对此的认识在不断深化。 对所有具有细胞结构的生命(未包括更简单的生命形式,如病毒等)的分类,先是分为原核生物和真核生物两大域。Karl Woese 于1977年把原核生物区分为细菌和古菌两大类,并于1990年正式提出应该把生命分为细菌、古菌和真核生物三大域。 目前的观点把生命之树的根节点,即最晚共同祖先(LUCA, last universal common ancestor)的位置放置细菌和古菌(含真核生物)中间。由于细菌和古菌中,横向基因转移(horizontal gene transfer,或lateral gene transfer)发生较多,生命之树在其根部更像网状,这也为推测生命之树带来很大困难。 另外,病毒能否被纳入生命之树? 关于生命之树的最新观点,可参阅以下综述文章。 Koonin, E. V. (2010) The Two Empires and Three Domains … 继续阅读

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